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建议你还是申请政府信息公开，对这块地的转用和征收程序是否合法进行查档，一般能够查清该地块的历史溯源，也能找到问题所在
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首先你自己的地应该有证吧，当初征地时都有坐标的，你直接带着证去国土局。再就是国土变更调查都是按现状调的，你没有用围墙圈起来肯定就调成别的地类了。还有河道绿地那一块，他们应该是没有正规手续的。至于基本农田的事赶快和国土局去沟通，现在正在做国土空间规划，如果真是当初搞错了，可以让他们调出来。你只要有土地证啥事都好办。
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黄色框内，2001征用的9.5亩，是有征地手续的。白框内的用地1.7亩，因为一直没有征地手续，后来几次调整土地利用规划时，出现了变数。因为这个变数，导致你有征地手续的9.5亩里，出现了基本农田。
你图中分析，可能出现的原因是，1.7亩里省道防护绿地建设时需要的建设用地指标，从你的9.5里补充平衡了；因为你里面减少的面积和与沿路补充的面积是相等的。现在上面说你侵占基本农田，就是因为你9.5里，出现了本不应该出来的基本农田。
1、你想证明，防护绿地建设时占用的建设用地指标，是经过农转用手续的，国有征用的，不是从你9.5亩用地里挪过来的。
2、你想证明，9.5里出现的基本农田，是土地利用规划修编的时候搞错了。
我觉得，
1、防护绿地：防护绿地变成国有，是需要经过划拨的，如果没有划拨手续，防护绿地这块地就不是国有建设用地。这个与你已经征用的9.5亩，没有直接的关系。
2、9.5亩的征地边界：当时国有征用的9.5亩征地坐标，是不会改变的。你需要可以找个有资质的测量公司，按当时发证的坐标，重新测绘一下，当做证据。这个是问题的关键，证明9.5亩的坐标位置，就是国有土地征用的位置。
你最好找个专业律师，起诉当地政府，原有的9.5亩的国有用地，怎么会出现基本农田。剩下的，所有调整需要的用地的证据，当地规划局就会出示。
